针对新机票价格体系的质疑，有关航空公司表示，新的运价系统运行后并不意味着机票价格就只涨不降，决定性力量还在市场供需。
“不知道怎么回事，我这边今天还能出六折机票，现在好像比较混乱。”21日，上海不夜城旅行社机票代理陈诚告诉中国证券报记者，按照新的票价体系，从20日开始不可能出现整数折扣的机票，只能报给客人机票具体多少价格，以前都是直接说打几折，因为现在票价折扣的基点为0.4，而不是过去的0.5，算起来非常麻烦。
据了解，新运价体系下机票折扣计算方式与此前有所变化，新的折扣率＝1－[（1－X）/1.25]，其中X是指目前机票的折扣。由此推算，未来9折机票的价格，相当于现在的9.2折；未来的8.5折机票价格，相当于现在8.8折的价格。
陈诚强调说，虽然出票系统是中航信的，但是具体票价优惠幅度的掌控权仍在航空公司手中。上海航空企业文化部副总经理王万龙表示，新的运价体系并不意味着涨价，合理票价是航空公司根据市场供需情况敲定，民航总局对这个情况有澄清说明。
东方航空董秘罗祝平也在密切关注着媒体有关新票价系统的报道，他认为定价系统或标准的改变不是决定因素，真正运行起来，机票价格还要看市场供求。如果过剩，机票价格还是会下来，三四折的票仍会在淡季出现。
“基准价上涨25%根本不可能，下浮45%经常被突破，以后一两百元的机票还会有。”罗祝平说，如果某段时期的某一航线供应过剩，各航空公司为争夺客源，还是会大幅降价。最近这个时期临近五一旺季，机票折扣本就比较低，可能导致舆论对新运价体系更加敏感。
采用廉价航空运营模式的上海春秋航空公司，从一开就没有使用中航信的订票系统，而是自主研发了自己的票务系统，因此新运价体系对春秋航空没有任何影响。这家依靠低廉价格吸引乘客的民营航空表示，今后依然会推99、199元系列低价票。
一位航空业研究员表示，国有三大航去年巨亏将近300亿元，震惊全社会。在这个节骨眼上，新的运价系统的确有人为抬高机票底价的嫌疑，使舆论认为航空公司要从消费者身上弥补亏损。建议对于关系到广大消费者利益的机票价格问题，不管是在政策上还是技术系统上进行修改时，首先应该进行听证。
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